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我的科學(xué)觀|盧煜明:還可以更進(jìn)一步嗎?
·即使我們找到了一個解決方案,我們依然可以再思考,也仍然需要繼續(xù)前進(jìn),或許就會有新的方案出現(xiàn)。
在科學(xué)研究中,或許在生活中的其他維度也是如此,不能只是走別人走過的路,要真正做出一些重要的、具有持久價值的東西,一些新的東西。
我致力于研究在血液中循環(huán)的DNA,這個領(lǐng)域的不尋常之處在于,DNA通常存在于細(xì)胞內(nèi)。但有趣的是,我在過去的25年里一直在觀察在細(xì)胞外循環(huán)的DNA,實(shí)際上一開始很多人認(rèn)為這方面可能不會有任何進(jìn)展。
我開始著手這個領(lǐng)域的工作,是因為產(chǎn)前診斷。一位孕婦如果想知道胎兒是否患有染色體疾病,最準(zhǔn)確的方法就是做羊水穿刺,但這技術(shù)是有入侵性的,而且有可能對胎兒造成傷害。因此,當(dāng)時作為一個年輕的醫(yī)科生,我想能不能從母親那里采集血液樣本來完成產(chǎn)前診斷,這樣就有可能避免風(fēng)險。
然而,我們知道嬰兒的血液循環(huán)系統(tǒng)和母親的血液循環(huán)系統(tǒng)是分開的,那怎么能做到呢?我想,也許現(xiàn)有的想法是不全面的,也許嬰兒會在母親的血液中釋放一點(diǎn)DNA。所以如果嬰兒是一個男孩,就可以在母親的血液中看到來自Y染色體的DNA。這是探索的第一步。
孕婦進(jìn)行產(chǎn)前檢查最首要的是出于對胎兒可能患有唐氏綜合征的擔(dān)心,即一般情況下人有46條染色體,唐氏綜合征胎兒則會多出一條21號染色體。那么要檢測是否真的患有唐氏綜合征,就必須從懷疑有唐氏綜合征的對象那里分離出細(xì)胞,然后分析這個細(xì)胞有多少條染色體。
但正如我所考慮的,DNA在細(xì)胞外“游泳”。所以怎么通過外部流動的東西去窺探內(nèi)部的情況?這實(shí)際上非常有趣,我們花了十年的時間才真正想到應(yīng)該怎樣做。
我們在想的是,如果有數(shù)百萬個分子漂浮在血液中,其中一些是嬰兒的,一些是母親的,因為我知道人類基因組序列,也許我可以隨機(jī)對這些DNA分子進(jìn)行排序,然后映射到每條染色體上。如果比例在考慮染色體的長度后是一比一,那是正常的,如果偏離一比一就是不尋常的。
這就像我想知道你錢包里有多少硬幣,我可以要求你現(xiàn)在把錢包拿到桌子上來,但這是「侵入性」的做法。另一種方式,如果我能創(chuàng)造一個公平、準(zhǔn)確的天平,請你站在天平上。當(dāng)你有兩枚硬幣時和你只有一枚硬幣時,你的體重會出現(xiàn)一點(diǎn)變化,我就可以用這種方式來獲知錢包里的硬幣數(shù)。
而當(dāng)我這樣做的時候,我發(fā)現(xiàn)測試的準(zhǔn)確性令人驚訝——準(zhǔn)確率為99.7%。這個準(zhǔn)確率如此之高,以至于我在完成這一技術(shù)的大型臨床測試的十個月內(nèi),這項技術(shù)便迅速被多間生物技術(shù)公司采用。而現(xiàn)在,它已經(jīng)成為世界上90多個國家或地區(qū)的臨床常規(guī)測試技術(shù)。這項技術(shù)被稱為無創(chuàng)產(chǎn)前檢測(Non- Invasive Prenatal Testing),簡稱NIPT。
通常情況下,如果遵循原有范式,在我完成這些工作以后,我就可以放松下來。但我決定挑戰(zhàn)自己,能不能創(chuàng)建另一個技術(shù)上不同的測試方式,而且是現(xiàn)有的模式里所不包括的?
我們的基因組有30億個堿基對,如果你把整個基因組的DNA分子串連起來,長度會非常驚人,大概有兩米。但當(dāng)我去測量的時候,卻發(fā)現(xiàn)血液循環(huán)中的DNA非常短,大約有50到200堿基對,胎兒游離DNA的大小分布會比母體游離DNA更短。
這意味著在血漿中,我們得到的嬰兒游離DNA越多,整體長度就會越短。于是通過一些計算,我們就能知道血漿中采集到的胎兒DNA濃度。這一點(diǎn)至關(guān)重要,因為濃度是無創(chuàng)性產(chǎn)前檢查準(zhǔn)確性的最重要決定因素。而在這項技術(shù)之前,要衡量準(zhǔn)確性是頗為復(fù)雜的事情。
還可以更進(jìn)一步嗎?
我們知道了母體游離DNA比胎兒游離DNA的大小分布更長,同時如果胎兒患有唐氏綜合征的話,它將有一個額外的第21號染色體,這也會釋放較短的DNA到母親的血液中。
那么,分離含有這些片段的血漿,對這些片段進(jìn)行測序,并與參考染色體序列進(jìn)行比對。然后通過計數(shù)來確定來自每條染色體的cfDNA(胎兒的cfDNA源于胎盤滋養(yǎng)細(xì)胞的更新,約占孕婦在孕中期時體內(nèi)總cfDNA的10%)相對長度,就可以判斷某條染色體相對比例是否過高。如果是來自21號染色體的cfDNA的相對長度不正常地短,那就表明胎兒有21三體綜合征。于是,這就設(shè)法創(chuàng)造了一種新的方法。
所以簡而言之,我希望通過這個歷程表達(dá)的是,即使我們找到了一個解決方案,我們依然可以再思考,也仍然需要繼續(xù)前進(jìn),或許就會有新的方案出現(xiàn)。
(作者盧煜明,分子生物學(xué)臨床應(yīng)用專家,英國皇家學(xué)會院士、美國國家科學(xué)院外籍院士、香港科學(xué)院創(chuàng)院院士、香港中文大學(xué)李嘉誠健康科學(xué)研究所所長及化學(xué)病理學(xué)系主任,2022年拉斯克臨床醫(yī)學(xué)研究獎獲得者、2021年科學(xué)突破獎–生命科學(xué)獎獲得者以及2016未來科學(xué)大獎-生命科學(xué)獎獲得者。本文部分內(nèi)容整理自盧煜明在“香港論壇·科學(xué)建未來”上的演講,經(jīng)作者審閱后,授權(quán)澎湃科技刊發(fā)。)





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