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“追兇”!上??茖W家發(fā)明新工具“狙擊”細胞衰老,解肝纖維化之謎

澎湃新聞記者 吳躍偉 實習生 黃煜博
2024-10-09 07:34
來源:澎湃新聞
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擁有這些技術的科研人員就像煉就了孫悟空的“火眼金睛”。

機體衰老和很多疾病,都與細胞衰老有關。但對細胞衰老的研究失之精確,因為人們一直缺乏能夠精準“狙擊”特定細胞類型的衰老細胞的研究工具,而只能追蹤所有衰老細胞。現(xiàn)在我們知道,肝纖維化也與細胞衰老相關。

本文圖片均來自微信公眾號@中國科學院分子細胞卓越中心

10月7日,澎湃科技從中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心(生物化學與細胞生物學研究所)獲悉,周斌研究組近日在國際學術期刊《細胞》(Cell)上發(fā)表了一篇題為《確定不同細胞類型細胞衰老的特定功能》(Identifying Specific Functional Roles for Senescence Across Cell Types)的論文。

衰老的p16-tdT小鼠多種細胞類型表達tdT

周斌研究組創(chuàng)新研究方法,精準追蹤特定細胞類型的衰老細胞,通過研究小鼠模型發(fā)現(xiàn),肝臟纖維化損傷中的細胞衰老主要與兩種細胞類型有關——巨噬細胞和內皮細胞;并首次確認,是由于衰老巨噬細胞的“拖累”和“作惡”,導致肝臟纖維化加劇。而清除相關細胞,可以改善肝臟纖維化。這一研究有望為相關臨床應用提供思路和理論依據(jù)。

簡而言之,周斌課題組發(fā)明了一套通用的研究方法和相關動物模型來解決上述科學問題,新方法更精準,也帶給人們更大的想象空間。

趙歡副研究員是上述論文的三位共同第一作者之一。她告訴澎湃科技,最新發(fā)表的論文一共報告了4套新系統(tǒng),建立了一種針對體內衰老細胞譜系追蹤并研究其特定功能的技術,“我們可以把工具小鼠共享出去,其他科學家可以研究衰老的其他類型細胞”,“比如,此前人們在神經(jīng)退行性疾病模型中研究發(fā)現(xiàn),其大腦中衰老的星狀膠質細胞和小膠質細胞會增多,而清除掉衰老細胞群體,對它的疾病有改善。用我們這套工具,就可以非常精準地研究其大腦中衰老的膠質細胞”。

細胞衰老是指細胞在執(zhí)行生命活動過程中,細胞增殖與分化能力及其生理功能隨著時間推移發(fā)生衰退的過程,此外,各種持續(xù)性細胞壓力也會誘導細胞衰老,如DNA損傷的積累、癌基因的激活、腫瘤抑制因子的喪失、活性氧的暴露等。

雖然它是新陳代謝的正常過程,但機體衰老和很多疾病,都跟細胞衰老有關。

看清衰老在不同尺度或水平上細胞衰老的細節(jié),甚至逆轉相關細胞衰老過程,是很多科學家的夢想。

如果把衰老細胞比作潛在犯罪分子,那么追蹤衰老細胞的這個過程就可以被比作是“追兇”。但因為缺少合適的研究方法和工具,人們難以“追兇”——無法追蹤特定的衰老細胞,也無法看清楚它們“從哪兒來,往哪兒去,要做什么”。

更復雜的是,衰老的細胞與新生的細胞可能毗鄰而生,這給現(xiàn)實中的研究更增加了難度。而且,有研究表明,衰老細胞在某些情況下可能發(fā)揮積極作用,如腫瘤抑制、胚胎發(fā)育、傷口愈合、毛發(fā)生長、促進肺再生等。

目前,人們認為,人體里大約有30萬億個細胞,超過400種細胞類型:成年男性約有36萬億個細胞,成年女性大約28萬億個細胞,兒童約有17萬億個細胞。在如此規(guī)模的細胞中“追兇”,難度可想而知。

不過,對細胞進行譜系追蹤是周斌研究組的強項。此前,人們使用“外源性標記”,比如利用“染色標記”的方法來追蹤細胞。但是,當細胞不斷分裂增殖,熒光也會被稀釋或代謝,最后難以被追蹤到。

而周斌研究組使用了一個強大的工具——遺傳譜系示蹤。這種技術利用基因打靶技術構建轉基因小鼠,將帶有特定啟動子的重組酶基因整合到細胞基因組中,與攜帶有報告基因的小鼠交配后,最終在子代小鼠中實現(xiàn)利用同源重組技術追蹤特定細胞。

傳統(tǒng)技術使用的是“Cre-loxP”的單同源重組系統(tǒng),存在一些局限性,主要是非特異性標記。周斌研究組在傳統(tǒng)的譜系示蹤系統(tǒng)上再疊加一個新的系統(tǒng)——Dre-rox,相當于雙限定條件,構建了一系列新的雙同源重組報告系統(tǒng),用兩種同源重組酶,能夠同時標記和追蹤兩種或三種不同的細胞群,讓示蹤結果更加精準,從而為發(fā)育、疾病和再生研究提供了新的技術選擇。

周斌研究團隊

周斌舉例說,比如一個教室有30位同學,想找到符合特定條件的同學,傳統(tǒng)的單同源重組酶系統(tǒng)相當于只設定一個條件,比如“長頭發(fā)”;雙同源重組意味著提出兩個特定條件,比如“長頭發(fā)”且“戴眼鏡”,結果更精確。

近年來,周斌研究組通過譜系示蹤技術,揭示了冠狀動脈的發(fā)育起源,并證明了成體心臟不存在能夠形成心肌細胞的內源性心臟干細胞;探索了肝臟血管的起源,并指出了成體肝臟中新生肝細胞主要來源區(qū)域。

趙歡告訴澎湃科技,通過雙同源重組系統(tǒng),他們實現(xiàn)了對體內特定細胞類型的衰老細胞的追蹤,發(fā)現(xiàn)其細胞命運,揭示其功能。因為遺傳示蹤技術的同源重組是在DNA水平上發(fā)生的,所以,被標記的目的細胞無論此后是分裂成了兩個細胞,還是發(fā)生了細胞分化——變?yōu)槠渌愋?,它和它所有的子代細胞會一直帶著這種熒光標記基因。此外,研究人員還可以實現(xiàn)對特定類型的細胞進行遺傳操作,比如基因敲除或過表達,或者細胞清除等。

趙歡介紹,在基因組水平上,p16Ink4a是研究細胞衰老廣泛使用的標志物之一。它是一種細胞周期蛋白依賴性激酶(CDK)抑制蛋白。“如果構建了p16Ink4a的Cre或者Dre小鼠,就可以實現(xiàn)‘捕捉’其體內所有衰老的細胞,但是沒有辦法做到細胞類型特異性。我們就把兩套系統(tǒng)結合起來,建立了雙同源重組系統(tǒng)。簡單來說,比如我可以用Cre同源重組酶去識別衰老細胞,然后用Dre同源重組酶去限定細胞類型,比如巨噬細胞,取它們兩個的交集,就是衰老的巨噬細胞。兩個限定,就可以對它進行更精準的遺傳操作,比如追蹤、清除等?!?/p>

趙歡說,除了肝臟,他們研究比較多的還有心臟和肺臟等重要器官,“我們實驗室還在開發(fā)鄰近細胞的遺傳操作技術,研究衰老細胞的微環(huán)境,比如它跟它周圍的鄰居細胞是怎么相互作用的;然后去調控這些衰老細胞或微環(huán)境細胞,以促進損傷修復和組織再生”。

    責任編輯:沈關哲
    圖片編輯:蔣立冬
    澎湃新聞報料:021-962866
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